Las misiones fueron creadas por las iglesías e individuos religiosos para alojar a los aborígenes, les enseñaron los valores cristianos y les formaron para trabajar.

Las misiones cristianas les ofrecían mejor protección física frente a violaciónes en maños de los pastores y por lo tanto diez misiones se establieron en el estado de Nueva Gales de Sur entre 1823 y 1923 y el resto de Australia.

La organización que estableció estas misiones, se llamó ¨AIM¨.

El objectivo¨de la misión ¨AIM¨, fue la separación de los niños de sus padres y les enseñaron a leer ¨la palabra de Dios¨ y les civilizaron en 1901.

Las actividades de ¨AIM¨ fueron únicas, porque sus misioneras eran mujeres. Las misioneras fueron enviadas a vivir con los indios que vivían en reservas.

Hubo otras misiones ambas católicas y crístianas y el objectivo de los misioneros y las misioneras fue salvar a los aborígenes de las costumbres paganas tales como los ritos sagrados, encantamientos, la poligamia y superstición. Los misioneros grabaaron mensajes religiosos en las lenguas indígenas, en particular contra vicios como el alcoholismo y las apuestas en 1908. Además, les alimentaron, les vestieron y les alojaron.

Hubo adoctrinamiento religioso a los adultos y niños indígenas, cuando asistían a las escuelas evangélicas en 1912. Los niños vivían en dormitorios y tenían rectoras estricas 

En los años cincuenta y sesenta algunos mestizos fueron adoptados por las familias caucásicas y separados de sus familías entre 1905 y 1969 por las agencias Australianas por abuso y maltrato. Se les conocía como los niños robados o la ¨generación robada¨.

En la primera guerra mundial, muchos jóvenes y adultos indígenas de las misiones, sirvieron en una unidad militar en Galipoli, Turquía. En la segunda guerra mundial hubo dos unidades militares indígenas que lucharon en Europa, Medio Oriente, Papua Nueva Gales y el Pacifico.

Los aborígenes que vivían en misiones en la Tierra de ¨Arnhem¨ del estado del Territiorio del Norte de Australia fueron en una unidad de reconocimiento durante el bombardeo de Darwin por los japoneses en 1945.